Tiêu đề 13. BGN (Partie 1_2).pdf ✅

RYM SD 1 Les principaux groupes bactériens en pathologie humaine BGN: Entérobactéries, Pseudomonas, Vibrionaceae I. Introduction – Généralités : -Les bactéries sont des microorganismes procaryotes dépourvus de noyau, possédant un ADN chromosomique circulaire situé dans le cytoplasme. Elles sont entourées d’une paroi. -Les bacilles à Gram négatif représentent un groupe de bactéries dont l’intérêt médical est avéré. Ils prennent la forme de petits bâtonnets apparaissant en rose sous le microscope optique après coloration de Gram. -Les bacilles à Gram négatif se caractérisent par la présence d’une membrane externe comprenant le fameux antigène O, impliqué notamment dans les chocs toxiques, mais également dans l’identification de souches génétiquement différentes appartenant à la même espèce. CLASSIFICATION GENERALE:
RYM SD 2 II – Enterobacteriaceae : Elle représente une vaste famille de bactéries qui comporte plusieurs genres, espèces et sérotypes (plus de 30 genres et 140 espèces).  Sont en général des hôtes du tube digestif de l’homme et des animaux. La famille d’Entérobactéries se définit par les caractères suivants :  BGN  Dépourvus d’Oxydase  Se développent sur milieux ordinaires  Aéro-anaérobie facultatif (AAF)  Réduction des NO3- en NO2-  Fermentation du glucose  Souvent mobiles grâce à une ciliature péritriche sauf Klebsiella et Shigella. Répartition en genres: La distinction entre les genres se fait par l’étude des caractères biochimiques : fermentation du lactose, production d'indole, production d'uréase, production d'acétoïne ... Caractérisation des espèces : Au sein de chaque genre, on individualise des espèces, par l'étude des caractères biochimiques ou antigéniques. Les entérobactéries possèdent toutes des antigènes de paroi «somatiques» ou antigènes O. Les entérobactéries mobiles possèdent en plus des antigènes de flagelle « flagellaires » ou antigènes H. Enfin, certains possèdent un antigène d'enveloppe ou antigène K.  Antigène O : est l'endotoxine des bactéries à Gram négatif. Les antigènes O ou somatiques correspondent aux polyosides fixés sur les lipopolysaccharides (LPS), il est très toxique.  Antigène H : il n'est pas toxique, de nature protéique (flagelles).  Les antigènes de surface comprenant : Les antigènes K, Vi ou capsulaires (de nature polyosidiques), les antigènes d'adhérence ou adhésines de nature protéique, portés par des pili communs (encore appelés fimbriae). 1- Escherichia coli : Principaux caractères bactériologiques : Mobile, indole (+), lactose (+), et citrate (-) Il existe différents sérotypes selon : - Ag somatique O et flagellaire H (ex: E. coli O157:H7) - Ag capsulaire K (ex: E. coli K1) Habitat : -hôte normal (commensale) du tube digestif (Homme et animaux). -Espèce dominante de la flore aérobie colique. Pouvoir pathogène :  Infections extra-intestinales: -Infections urinaires Souches dites Uropathogènes -Infections intra-abdominales : cholécystites, péritonites, appendicites -Infections osteo-articulaires -Bactériémies -Méningites néonatales (dues a E. coli K1) -Infections de plaies chirurgicales  Infections intestinales: Diarrhées infectieuses: -Par sécrétion d'entérotoxine (E. coli entérotoxinogénes ETEC), ils peuvent provoquer des diarrhées aiguës, « cholera-like ».
RYM SD 3 -Par fixation sur la surface des cellules de la muqueuse, abrasion de la bordure en brosse des villosités intestinales et production de cytotoxines (E. coli entérohémorragiques EHEC), les EHEC provoquent une diarrhée aiguë, acqueuse, puis hémorragique, sans pus ni fièvre SLT Shigella like Toxine -Par invasion de la muqueuse colique, certains colibacilles (E. coli entéroinvasifs EIEC) provoquent des diarrhées aiguës, « dysenterie-like » -Certaines souches d'E. coli sont associées à des diarrhées et sont clairement entéropathogènes (E. coli entéropathogènes EPEC) grâce à des propriétés d'adhésion particulières. Elles ne sont ni sécrétrices d'entérotoxine, ni entéro-invasives. Diagnostic bactériologique -Prélèvements : urines, hémocultures, LCR, pus, selles... -Diagnostic bactériologique direct: repose sur l’isolement et l’identification de la bactérie. -Recherche d’antigènes solubles (E.coli K1) -Recherche des entérotoxines . Résistance aux antibiotiques, Traitement: -E.Coli est sensible de façon naturelle à toutes les ß lactamines . -La résistance acquise est surtout enzymatique par sécrétion d’une pénicillinase, cephalosporinase, ß-lactamase à spectre étendu. -La résistance aux aminosides: inactivation enzymatique -La résistance aux quinolones est chromosomique (diminution d’affinité de l’ADN gyrase ou imperméabilité par porines modifiées. -Elles sont résistantes aux macrolides, lincosamides et synergistines. 2- Salmonella: -Les salmonelles sont ubiquitaires, ce sont des hôtes habituels du tube digestif, mobiles qui se disséminent dans la nature par les excréments (Matière évacuée du corps par les voies naturelles ; spécialement matières fécales évacuées par le rectum). -Le genre Salmonella comprend deux espèces :  Salmonella enterica  Salmonella bongori. -Les salmonelles sont subdivisées sur la base de leurs antigènes O, H et K en 2500 sérovars ↔Classification de Kaufmann et white (Sérotypage) Pouvoir pathogène : -Les sérovars Typhi, Paratyphi A, Paratyphi B, et plus rarement Paratyphi C: ne sont isolés que chez l'homme et sont responsables de fièvres typhoïdes. -Les salmonelles non typhoidiques: sont des pathogènes zoonotiques alimentaires transmises à l’homme par des produits alimentaires d’origine animale:  responsables de gastro-entérites  infections extraintestinales : urinaires , méningites , articulaires Diagnostic bactériologique: Prélèvements :  Selles, Hémocultures , autres ....  Identification biochimique , Sérotypage (tableau de kaufmann et white)  Sérodiagnostic de fièvre typhoïde Traitement: -Les Salmonelles sont généralement sensibles aux antibiotiques actifs contre les bacilles à Gram négatif. -Certaines résistances sont possibles et impliquent la pratique d'un antibiogramme. -Les fièvres typhoïdes sont traitées par une céphalosporine de troisième génération et les fluoroquinolones. En Algérie Les phenicolés : chloramphenicol. -Les gastro-entérites relèvent essentiellement d'un traitement symptomatique comprenant régime et réhydratation.
RYM SD 4 3- Shigella : Les Shigella sont des entérobactéries toujours immobiles ne fermentant pas le lactose. Les caractères biochimiques et antigéniques permettent de distinguer 4 espèces:  Shigella dysenteriae (10 sérotypes) dont le bacille de shiga sérotype 1  Shigella flexneri (6 sérotypes)  Shigella boydii (15 sérotypes)  Shigella sonnei (1 sérotype). -Elle est strictement humaine, la transmission est féco-orale. -Elles sont responsables de "la dysenterie bacillaire" (Shigella dysenteriae), elles sont la cause:  Chez l'adulte, de colites infectieuses.  Chez l'enfant, de gastro-entérites sévères avec diarrhée mucopurulente et sanglante, fièvre et déshydratation. Diagnostic bactériologique: Coproculture: isolement sur milieux sélectifs, identification biochimique, identification antigénique par l’agglutination à l’aide de sérums spécifiques. Traitement: Les shigelles sont sensibles aux antibiotiques mais la possibilité de résistances acquises impose un antibiogramme. 4-Proteus –Providencia la tribu des Proteeae ( mobiles , Tryptophane Désaminase + souvent Urée +) 1- Proteus : espèces mirabilis, vulgaris et penneri 2- Morganella: espèce morganii 3- Providencia : espèces stuartii, rettgeri. -Toutes ces bactéries produisent des désaminases (tryptophane désaminase et phénylalanine désaminase). -Les Proteus produisent en outre une uréase -Ce sont des bactéries de l'environnement et des commensaux de l'intestin de l'homme et des animaux, qui peuvent etre responsables de divers infections 5- Klebsiella-Enterobacter- Serratia  Klebsiella (Enterobactérie immobile capsulé VP+) : K. pneumoniae et K. oxytoca  Enterobacter (Enterobactérie mobile VP+) : E. cloacae et E. aerogenes  Serratia (Enterobactérie mobile VP+) : S. marcescens et S.liquefaciens. -Très répandues dans l'environnement (eau, sol, poussière), Commensales du tube digestif, et orifices naturels. -Responsables diverses affections (notamment nosocomiales chez des patients fragilises) : infections broncho-pulmonaires, urinaires, post-chirurgicales, bacteriemies. Souvent résistantes aux antibiotiques (antibiogramme indispensable) 6- Yersinia Ce sont de petits bacilles à Gram négatif, à coloration bipolaire, immobiles, cultivant sur milieux ordinaires ou sur milieux spéciaux pour entérobactéries (gélose SS) mais en donnant des petites colonies. Elles possèdent une uréase mais pas de désaminases, à la !!!!! Les principales espèces du genre sont: Yersinia pestis, Yersinia pseudotuberculosis, Yersinia enterocolitica. A-Yersinia pestis : -Agent de la peste découvert par Yersin a Hong Kong en 1894 -Maladie des rongeurs transmise a l'homme par la puce du rat (Pulex irritans) -Elle provoque :  La peste bubonique : adénite réactionnelle (2-7 j) avec bactériémie et atteinte pulmonaire  La peste pulmonaire : transmission interhumaine par voie aérienne -Diagnostic bactériologique par ponction ganglionnaire, hémoculture, crachats -Traitement: Souvent résistante aux antibiotiques : streptomycine, cyclines