Nội dung text TEXTO BASE DE BIOQUIMICA I ANA MAGDALENA CAMPOS TRIGOSO.pdf
APUNTES DE BIOQUIMICA I (BYF-B-13107) UNIVERSIDAD AUTONOMA DEL BENI JOSE BALLIVIAN CARRERA DE BIOQUIMICA Y FARMACIA Campos Trigoso PERTENECE A:....................................................................................... GESTION 2024 Anita
CONTENIDO Pag ́s GENERALIDADES DE BIOQUIMICA ......................................................................................1 1. Categorías ........................................................................................................................................................................... 1 1.1. Biomoléculas......................................................................................................................................................... 1 1.2. Biocatálisis ........................................................................................................................................................... 1 1.3. Biotransducción ................................................................................................................................................... 1 1.4. Biotransformación............................................................................................................................................... 1 1.5. Bioinformación ..................................................................................................................................................... 1 2. Principios ............................................................................................................................................................................. 1 2.1. Principio del recambio continuo ......................................................................................................................... 1 2.2. Principio de la organización de las macromoléculas......................................................................................... 1 2.3. Principio de la multiplicidad de utilización ....................................................................................................... 1 2.4. Principio de la máxima eficiencia....................................................................................................................... 1 2.5. Principio de la máxima economía........................................................................................................................ 1 2.6. Principio de los cambios graduales .................................................................................................................... 1 2.7. Principio de la interrelación ..............................................................................................................................2 2.8. Principio del acoplamiento ..................................................................................................................................2 2.9. Principio de la reciprocidad de las transformaciones.....................................................................................2 2.10. Principio de transferencia de información.......................................................................................................2 3. Vocabulario..........................................................................................................................................................................3 COMPOSICION QUIMICA DEL ORGANISMO ...........................................................................4 1. Elementos biógenos............................................................................................................................................................4 2. Clasificación ........................................................................................................................................................................5 2.1. Primarios...............................................................................................................................................................5 2.2. Secundarios..........................................................................................................................................................5 2.3. Oligoelementos ....................................................................................................................................................5 Digresión No. 1 Isótopos ....................................................................................................................................6 Digresión No. 2 Deficiencia debido a una falta de elementos traza ............................................................7 Información No. 1 Grupos Funcionales .............................................................................................................8 Información No. 2 La isomería enriquece la diversidad molecular ...............................................................9 Información No. 3 Las interacciones no covalentes son de naturaleza electrostática.............................12 BIOMOLECULAS............................................................................................................ 27 1. Definición ...........................................................................................................................................................................29 2. Clasificación .......................................................................................................................................................................29 2.1. Glúcidos ...............................................................................................................................................................29 2.2. Prótidos ...............................................................................................................................................................29 2.3. Lípidos..................................................................................................................................................................29 2.4. Sustancias nucleotídicas ...................................................................................................................................29 AGUA ........................................................................................................................ 14 1. La molécula de agua es polar............................................................................................................................................14 2. El agua como solvente .......................................................................................................................................................18 2.1. Compuestos iónicos.............................................................................................................................................18 2.2. Compuestos polares no iónicos..........................................................................................................................19 2.3. Compuestos apolares..........................................................................................................................................20 2.4. Compuestos anfipáticos.....................................................................................................................................20 3. El agua es un enlace reactivo ...........................................................................................................................................20 4. Los liquidos biológicos están tamponados .....................................................................................................................23 Digresión No. 3 Tamponación del pH de la Sangre........................................................................................................24 5. Las células están bajo presión osmótica.........................................................................................................................24 Test de agua ......................................................................................................................................................................26
HIDRATOS DE CARBONO................................................................................................. 30 1. Generalidades ....................................................................................................................................................................30 2. Concepto y clasificación ...................................................................................................................................................31 3. Monosacáridos ..................................................................................................................................................................32 3.1. Clasificación ........................................................................................................................................................32 3.2. Isomería ..............................................................................................................................................................33 3.3. Tarea....................................................................................................................................................................37 3.4. Interconversión entre aldosas y cetosas........................................................................................................39 3.5. Formas cíclicas de los monosacáridos..............................................................................................................40 3.6. Enlace hemiacetal y Hemicetal.........................................................................................................................40 3.7. Anómeros α y β ..................................................................................................................................................43 3.7.1. Fórmulas de Haworth .................................................................................................................................44 3.8. Monosacáridos derivados ..................................................................................................................................45 3.8.1. Monosacáridos ácidos.................................................................................................................................46 3.8.2. Producto de reducción de las hexosas .....................................................................................................48 3.8.3. Desoxiazúcares ...........................................................................................................................................50 3.8.4. Esteres fosfóricos......................................................................................................................................51 3.8.5. Aminoazúcares ............................................................................................................................................52 3.8.6. Osazonas ......................................................................................................................................................53 3.9. Derivados glicosídicos........................................................................................................................................54 3.9.1. Enlace acetal ...............................................................................................................................................54 3.9.2. Nomenclatura ..............................................................................................................................................55 3.10. Los glicósidos ......................................................................................................................................................55 3.11. Tarea....................................................................................................................................................................57 4. Disacáridos.........................................................................................................................................................................59 4.1. Homodisacáridos.................................................................................................................................................59 4.1.1. Maltosa.........................................................................................................................................................59 4.1.2. Isomaltosa ...................................................................................................................................................59 4.1.3. Celobiosa......................................................................................................................................................59 4.1.4. Trealosa .......................................................................................................................................................59 4.2. Heterodisacáridos..............................................................................................................................................59 4.2.1. Lactosa.........................................................................................................................................................61 4.2.2. Sacarosa.......................................................................................................................................................61 4.2.3. Pectina..........................................................................................................................................................62 4.2.4. Inulina...........................................................................................................................................................62 5. Polisacáridos.......................................................................................................................................................................62 5.1. Clasificación ........................................................................................................................................................62 5.1.1. Polisacáridos de reserva ............................................................................................................................62 5.1.1.1. Almidon..........................................................................................................................................62 5.1.1.2. Glucógeno......................................................................................................................................65 5.1.2. Polisacáridos estructurales .......................................................................................................................68 5.1.2.1. Quitina ..........................................................................................................................................68 5.1.2.2. Celulosa .........................................................................................................................................69 5.1.3. Homopolisacáridos ......................................................................................................................................72 5.1.4. Heteropolisacáridos ...................................................................................................................................72 5.1.4.1. Glucosaminoglicanos o mucopolisacáridos ácidos .....................................................................73 5.1.4.1.1. Ácido hialurónico...........................................................................................................73 5.1.4.1.2. Condroitín sulfato.........................................................................................................75 5.1.4.1.3. Dermatán sulfato..........................................................................................................75 5.1.4.1.4. Queratán sulfato ..........................................................................................................76 5.1.4.1.5. Heparina.........................................................................................................................76 5.1.4.2. Proteoglicanos ..............................................................................................................................77 5.1.4.3. Peptidoglicanos.............................................................................................................................82
Tincion de gram............................................................................................................................84 5.1.4.4. Glicoproteínas...............................................................................................................................87 5.1.4.4.1. Glicoproteínas con unión N-glicosídica.......................................................................88 5.1.4.4.2. Glicoproteínas con unión O-glicosídica.......................................................................89 Test de glúcidos ................................................................................................................................................................92 AMINOACIDOS Y PROTEINAS........................................................................................... 96 1. Concepto de aminoácidos..................................................................................................................................................96 1.1. Funciones.............................................................................................................................................................96 1.2. Estructura de los aminoácidos que constituyen las proteínas ......................................................................97 1.3. Clasificación .......................................................................................................................................................100 1.4. Propiedades físicas de los aminoácidos .......................................................................................................... 101 1.5. Propiedades eléctricas de los aminoácidos ....................................................................................................105 1.5.1. Punto isoeléctrico de los aminoácidos .....................................................................................................106 1.5.2. Electroforesis de aminoácidos.................................................................................................................108 1.6. Propiedades químicas de los aminoácidos .......................................................................................................108 1.6.1. Formación de la base de Schiff con piridoxal fosfato .........................................................................108 1.6.2. Formación de aminas biógenas .................................................................................................................109 1.6.3. Reacción de la Ninhidrina.......................................................................................................................... 110 1.6.4. Reacción de biuret..................................................................................................................................... 111 1.6.5. Error proteico de los indicadores............................................................................................................ 111 1.6.6. Formación del enlace peptídico................................................................................................................ 111 1.6.6.1. Oligopéotidos............................................................................................................................... 114 1.6.6.2. Polipéptidos.................................................................................................................................. 114 1.6.6.3. Proteínas ...................................................................................................................................... 114 1.6.6.4. Nomenclatura .............................................................................................................................. 115 Tarea ............................................................................................................................................ 115 2. Proteínas............................................................................................................................................................................ 117 2.1. Estructura primaria .......................................................................................................................................... 117 Digresión No. 4 Modificacion postraduccionales de TRH ............................................................................ 118 Digresión No. 5 Modificaciones de las cadenas laterales de los aminoácidos .......................................... 119 2.2. Estructura secundaria ......................................................................................................................................120 2.2.1. α-Hélice.......................................................................................................................................................120 2.2.2. conformación β...........................................................................................................................................123 2.2.3. los elementos de estructura secundaria forman motivos repetitivos ..............................................126 2.3. Estructura terciaria .........................................................................................................................................128 2.3.1. Interacciones salinas.................................................................................................................................128 2.3.2. Fuerzas de Van der Wals..........................................................................................................................128 2.3.3. Puentes de hidrógeno ................................................................................................................................128 2.3.4. Puente disulfuro.........................................................................................................................................128 2.3.5. Uniones hidrofóbicas.................................................................................................................................128 2.3.6. Las interacciones no covalentes estabilizan la estructura terciaria .................................................129 2.4. Estructura cuaternaria.....................................................................................................................................130 2.4.1. Varias subunidades forman la estructura cuaternaria de las proteínas............................................130 2.4.2. Las proteínas se pliegan gradualmente hasta alcanzar su conformación nativa.............................. 131 Digresion No. 7 Energía libre de plegamiento de las proteínas ...........................................................132 2.5. Clasificación de las proteínas ..........................................................................................................................133 2.5.1. Por su forma ...............................................................................................................................................133 2.5.2. Por su solubilidad .......................................................................................................................................133 2.5.3. Por su composición .....................................................................................................................................133 2.5.4. Por su función , según su actividad biológica..........................................................................................133 2.5.5. Por la electroforesis ................................................................................................................................134 3. Proteínas fibrosas ............................................................................................................................................................134 3.1. La queratina es una hélice de hélices ............................................................................................................135