Title 2022 OSNP Biologi - Soal.pdf ✅

Dr. Al mengkultur 4 strain E. coli diploid parsial dengan genotip sesuai yang tertera di tabel. Strain Genotipe I trpR+ trpP+ trpO+ trpL+ trpA+ trpB- trpC+ trpD+ trpE+ / trpR+ trpP+ trpOc trpL- trpA+ trpB- trpC- trpD+ trpE+ II trpR+ trpP- trpO+ trpL- trpA+ trpB+ trpC+ trpD+ trpE+ / trpRm trpP+ trpO+ trpL+ trpA- trpB+ trpC+ trpD+ trpE+ III trpR+ trpP+ trpO+ trpL- trpA+ trpB+ trpC+ trpD+ trpE- / trpRm trpP- trpOc trpL+ trpA+ trpB+ trpC+ trpD+ trpE+ IV trpRm trpP+ trpOc trpL+ trpA+ trpB+ trpC+ trpD+ trpE+ / trpR+ trpP- trpOc trpL+ trpA+ trpB+ trpC- trpD+ trpE+ Keterangan: trpRm = tidak mampu mengikat triptofan, trpOc = tidak mampu mengikat represor, trpL- = tidak memiliki fragmen penyandi leader peptide. Tentukan apakah pernyataan berikut benar (B) atau salah (S)! A. Keadaan diploid parsial diperoleh dengan menyisipkan salinan komponen operon trp ke kromosom E. coli, bukan dengan mentransformasikan E. coli dengan plasmid yang mengandung salinan komponen operon trp. B. Dalam keadaan tidak terdapat triptofan di media pertumbuhan, E. coli yang tidak memiliki trpL dapat mengalami kegagalan dalam melakukan anabolisme triptofan. C. Strain yang tetap dapat memproduksi triptofan dalam keadaan terdapat triptofan di media pertumbuhan adalah strain III dan IV. D. Strain I dan II hanya dapat tumbuh di media yang disuplementasi dengan triptofan.
3. Sistem molecular chaperone dari Escherichia coli (Gambar 1) dapat direkayasa untuk meningkatkan produksi protein rekombinan yang terlarut dan aktif di E. coli. Hal ini dilakukan dengan menghubungkannya secara langsung dengan sistem ekspresi protein (Gambar 2) yang keefektifannya dibuktikan dengan assay komplementasi superfolder GFP (sfGFP) (Gambar 3). Gambar 1. Sistem molecular chaperone di E. coli (sumber: doi.org/10.1038/nbt1029) Gambar 2. Sistem sintetik yang meng-couple sistem translasi dan pelipatan protein di E. coli.
Gambar 3. Assay komplementasi sfGFP (sumber: doi.org/10.3390/ijms20133163) Tentukan apakah pernyataan berikut benar (B) atau salah (S)! A. Kondisi kultur ideal untuk produksi protein rekombinan di E. coli adalah kultur anaerob. B. Dalam assay komplementasi superfolder GFP, fragmen C termini selalu diproduksi dalam bentuk agregat. C. Jika pada assay komplementasi superfolder GFP digunakan strain E. coli mutan ΔgrpE, ekspresi N-terminal dari sfGFP kemungkinan besar dapat dideteksi melalui western blot menggunakan antibodi terhadap DnaJ. D. Sistem pada gambar 2 dibentuk dengan menambahkan urutan nukleotida yang mampu membentuk DNA hairpin pada area downstream dari kodon stop gen pengkode protein rekombinan. 4. Iturin V adalah senyawa antimikroba yang dihasilkan oleh bakteri genus Lactobacillus. Paparan iturin V terhadap berbagai jenis sel, termasuk bakteri patogen manusia ditunjukkan pada gambar 1 di bawah ini.