Content text 6. Задача 2 с алгоритмом решения.docx
Ситуационная задача с алгоритмом решения Задача. Интерпретировать (оценить) результаты исследования микробиоценоза толстого кишечника, выполненного при помощи тест- системы «Колонофлор-16 (биоценоз)». Укажите недостаток данного метода. Мужчина, 39 лет. Результаты анализа: общее бактериальное число 6·10 12 КОЕ/г, лактобактерии 8·10 5 КОЕ/г, бифидобактерии – 2·10 8 КОЕ/г, E.coli –1·10 5 КОЕ/г, Bacteroides fragilis group4·10 12 КОЕ/г, Bacteroiders thetaiotaomicron – не обнаружено, Faecalibacterium prausnitzii – 3·10 9 КОЕ/г, Akkermansia muciniphila – не обнаружено, соотношение Bacteroidesspp./Faecalibacterium prausnitzii – 1333, Escherichia coli enteropathogenic – не обнаружено, Enterococcus spp. менее 1·10 5 КОЕ/г, Proteus vulgaris/mirabilis – не обнаружено, Citrobacter spp./Enterobacter spp. 2·10 8 КОЕ/г, Parvimonas micra– не обнаружено, Candida spp. – не обнаружено, Clostridium difficile – не обнаружено, Clostridium perfringens – не обнаружено, Fusobacterium nucleatum – не обнаружено, Klebsiellaoxytoca– не обнаружено, Klebsiellapneumoniae– не обнаружено, Salmonella spp. – не обнаружено, Shigellaspp.– не обнаружено, S.aureus – не обнаружено. Алгоритм решения. Пример интерпретации результатов в ходе практического использования тест-системы «Колонофлор» для исследования микробиоты просвета толстой кишки. Заключение: Снижено количество Lactobacillus spp. – признак дисбиоза кишечника. Дефицит лактобацилл способствует снижению противовирусной и противоаллергической защиты, нарушению ферментации лактозы. Снижено количество Bifidobacterium spp. – признак выраженного дисбиоза. Дефицит бифидофлоры способствует нарушению углеводного обмена, снижению синтеза и усвоения витаминов и микроэлементов. Негативно сказывается на состоянии местного иммунитета кишечника.
Снижено количество E.coli, выявлены энтеробактерии родов Enterobacterи Citrobacter в количестве 2·10 8 КОЕ/г. Признак дисбактериоза кишечника. Может выступать в качестве этиологического фактора гастрита, энтерита или гастроэнтерита. Анаэробный дисбаланс (количество бактероидов значительно превышает количество Faecalibacterium prausnitzii). Состояние анаэробного дисбаланса характерно для ВЗК (болезнь Крона, неспецифический язвенный колит) и аутоиммунной патологии. Указывает на нарушенное состояние местного иммунитета кишечника. При выявлении рекомендовано углубленное обследование для исключения вышеперечисленных состояний. Недостатком данного метода является то, что при оценке полученных результатов не учитывается соотношение анаэробов (суммарного пула) и факультативно анаэробных и аэробных микроорганизмов, а предлагается оценивать микробиоценоз по количественной представленности каждого микроорганизма в микробиоте. То есть не учитывается одно из основных свойств микробиоты – функциональная избыточность, когда даже представители других семейств и родов могут «брать на себя» метаболические функции, выполняемые, например, бифидобактериями, лактобациллами и др. Это влечет за собой гипердиагностику дисбиозов, снижает настороженность инфекционистов по отношению к кишечным инфекциям, вызванным УПМ (например, некоторые серотипы условно- патогенного микроорганизма Citrobacterfreundiiмогут вызывать кишечные инфекции с диарейным синдромом). Приложение 1. Таблица. Изменения состава микробиоты толстого кишечника, выявляемые с применением тест-системы «КОЛОНОФЛОР» и их клиническая значимость (Приложение к рабочей инструкции производителя (https://alphalabs.ru) 1. Диагностическое значение выявления патогенных микроорганизмов и/или увеличения содержания отдельных представителей условно-патогенной флоры (микробиоценоза кишечника) Микроорганизм Выявляемое изменение Форма комплектации Клиническая значимость Candidaspp Обнаружение в количестве, превышающем 10 4 «КОЛОНОФЛОР-8» «КОЛОНОФЛОР-16 (биоценоз)» Признак тяжело протекающего дисбактериоза кишечника. При генерализации процесса (повышение титра до более 10 ^7) возможно развитие кандидомикозного сепсиса.
Может выявляться (наряду с Clostridium perfringens, Staphylococcus aureus, Klebsiella oxytoca, Salmonella spp) при антибиотик- ассоцированной диарее, а также при иммунодефицитных состояниях. При обнаружении рекомендовано проведение типирования для определения видовой принадлежности грибов рода Candida и исследование лекарственной устойчивости Staphylococcusaureus Обнаружение в количестве, превышающем 10 4 «КОЛОНОФЛОР-8» «КОЛОНОФЛОР-16 (биоценоз)» Этиологический фактор развития воспалительных заболеваний кишечника (гастроэнтерит, энтерит, энтероколит). Указывает на развитие стафилококкового дисбактериоза, часто в результате антибиотикотерапии. При выявлении рекомендовано исследование на наличие генов устойчивости к антибиотикам (MRSA- резистентность). Klebsiellaspp Обнаружение в количестве, превышающем 10 4 «КОЛОНОФЛОР-8» Признак дисбактериоза кишечника. Характерно наличие диспептических явлений (тошнота, рвота, боли в животе, диарея); возможны симптомы интоксикации (повышение температуры, общая слабость). При развитии клебсиеллезов, обусловленных усиленным размножением в кишечнике представителей рода Klebsiella, наряду с поражением желудочно-кишечного тракта возможно поражение органов дыхания. Klebsiellapneumoniae Обнаружение в количестве, превышающем 10 4 «КОЛОНОФЛОР-16 (биоценоз)» Признак дисбактериоза кишечника. Характерно наличие диспептических явлений (тошнота, рвота, боли в животе, диарея); возможны симптомы интоксикации (повышение температуры, общая слабость). Возможно развитие осложнений с поражением дыхательных путей (чаще- бронхиты, бронхопневмонии, реже-долевые пневмонии). Klebsiella oxytoca Обнаружение в количестве, превышающем 10 4 «КОЛОНОФЛОР-16 (биоценоз)» Признак дисбактериоза кишечника. Сопровождается диспептическими явлениями (тошнота, боли в животе, диарея); возможны симптомы интоксикации (повышение температуры, общая слабость). Klebsiella oxytoca является одним из наиболее частых бактериальных агентов, вызывающих антибиотик-ассоцированную диарею (ААД). Может быть причиной геморрагического антибиотик-ассоциированного колита ( в 85 % случаев развивается после применения ампициллин/сульбактама). Активация Klebsiella oxytoca отмечается, как правило, на фоне терапии β-лактамами. Clostridium difficile Обнаружение в количестве, превышающем 10^4 «КОЛОНОФЛОР-8» «КОЛОНОФЛОР-16 (биоценоз)» Наиболее частый этиологический фактор развития антибиотик-ассоциированной диареи и псевдомембранозного колита. При выявлении рекомендовано дополнительное обследование для выявления токсигенных штаммов. Clostridium perfringens Обнаружение в количестве, превышающем «КОЛОНОФЛОР-8» «КОЛОНОФЛОР-16 (биоценоз)» Clostridiumperfringens, тип А вызывает пищевые токсикоинфекции легкой и средней тяжести, является одной из наиболее частых
10^4 причин развития антибиотик- ассоцированной диареи. Clostridiumperfringens, тип С вызывает некротический энтерит. Proteusvulgaris/mirabi lis Обнаружение в количестве, превышающем 10^4 «КОЛОНОФЛОР-16 (биоценоз)» Может являться причиной протейного дисбактериоза, часто в результате антибиотикотерапии, при различных воспалительных заболеваниях ЖКТ (пищевые токсикоинфекции, неспецефический язвенный колит и т.д.) Escherichia coli enteropathogenic Обнаружение в количестве, превышающем 10^4 «КОЛОНОФЛОР-16 (биоценоз)» Группа бактерий, обуславливающая развитие острых кишечных инфекционных заболеваний (ОКИ). Возможно бессимптомное носительство. Citrobacterspp. Обнаружение в количестве, превышающем 10^4 «КОЛОНОФЛОР-16 (биоценоз)» Признак дисбактериоза кишечника. Может выступать в качестве этиологического фактора гастрита, энтерита или гастроэнтерита. Enterobacterspp. Обнаружение в количестве, превышающем 10^4 «КОЛОНОФЛОР-16 (биоценоз)» Признак дисбактериоза кишечника. Может выступать в качестве этиологического фактора гастрита, энтерита или гастроэнтерита. Fusobacteriumnucleat um Обнаружение в любом количестве «КОЛОНОФЛОР-16 (биоценоз)» F.nucleatum создает провоспалительное микроокружение (активирует транскрипционный фактор NF-κB, запускает сигнальный путь Wnt), благоприятствующее развитию неопластических процессов в толстом кишечнике. Повышенное содержание F.nucleatum в просветной флоре может являться ранним маркером канцерогенеза. При обнаружении рекомендовано дополнительное инструментальное обследование для исключения новообразований кишечника. Parvimonasmicra Обнаружение в любом количестве «КОЛОНОФЛОР-16 (биоценоз)» P. micra является фактором, способствующим развитию канцерогенеза в толстом кишечнике. Предположительно является одним из ранних маркеров канцерогенеза в толстом кишечнике. При обнаружении рекомендовано дополнительное инструментальное обследование для исключения новообразований кишечника Salmonella spp Обнаружение в любом количестве «КОЛОНОФЛОР-16 (биоценоз)» Представители рода Salmonella являются возбудителями энтероколитов (пищевой токсикоинфекции), а также генерализованного тифопаратифозного инфекционного процесса. Патологическое действие обусловлено наличием токсинов (энтеротоксины, цитотоксины, эндотоксины) Shigella Обнаружение в любом количестве «КОЛОНОФЛОР-16 (биоценоз)» Представители рода Shigella являются возбудителями бактериальной дизентерии (шигеллеза) – острой кишечной инфекции, поражающей слизистую оболочку толстого кишечника. Патогенное действие обусловлено наличием токсинов (эндотоксины, экзотоксины, энтеротоксины, нейротоксины). Угнетают рост нормальной микрофлоры, способствуют развитию дисбиоза.