Title ФБМФ ИББ_Лаборатория биохимических исследований канцерогенеза_публичная версия 2.1_04.04.2024.pdf ✅

Лаборатория биохимических исследований канцерогенеза внутренняя версия 2.1 от 04.04.2024 Содержание Содержание 1 Описание лаборатории 2 Направления деятельности лаборатории 6 A. Прикладные разработки 6 1. Двухстадийная адресная доставка противораковых препаратов 6 2. ZytoFusin – адресный противораковый полипептид 7 3. Виварий для доклинических исследований 7 B. Исследования (фундаментальные) и прикладные применения 8 1. Синтез и характеристика наноструктур самой различной природы 8 a. Компетенции и примеры реализованных проектов: 8 b. Потенциальные направления развития данных компетенций: 8 2. Методы химической конъюгации 9 a. Компетенции и примеры реализованных проектов: 9 b. Потенциальные направления развития данных компетенций: 9 3. Исследования in vitro с неживыми объектами, методы диагностики 10 a. Компетенции и примеры реализованных проектов: 10 b. Потенциальные направления развития данных компетенций: 10 4. Исследования in vitro с живыми объектами: клетки эукариот и бактерии 10 a. Компетенции и примеры реализованных проектов: 10 b. Потенциальные направления развития данных компетенций: 11 5. Исследования in vivo (грызуны): исследования поведения соединений в организме 11 a. Компетенции и примеры реализованных проектов: 11 b. Потенциальные направления развития данных компетенций: 12 6. Исследования in vivo (грызуны): разработка методов противораковой терапии 12 a. Компетенции и примеры реализованных проектов: 12 b. Потенциальные направления развития данных компетенций: 12 7. Клеточная биология 13 a. Компетенции и примеры реализованных проектов: 13 8. Фундаментальные поисковые исследования в области канцерогенеза 13 9. Разработка фундаментально новых схем противораковой терапии 13 10. Исследование терапевтической эффективности и системной токсичности препаратов 13 C. Образование 13 a. Перечень компетенций: 13 b. Примеры проектов: 14 1
Описание лаборатории 1. Название Физтех-школы: Физтех-школа биологической и медицинской физики (ФБМФ) / Институт биофизики будущего (ИББ) 2. Название лаборатории + ссылка на оф. страницу/сайт: Лаборатория биохимических исследований канцерогенеза 3. Руководитель лаборатории: I. ФИО, ссылка на оф. страницу/сайт: Шипунова Виктория Олеговна II. ученая степень: к.б.н. 4. Прикладная или фундаментальная лаборатория: прикладная 5. Названия областей, в которых работает лаборатория: ○ Онкология / Раковые заболевания / Опухоли ○ Канцерогенез ○ Диагностика и терапия раковых опухолей ○ Химиотерапия ○ Умные материалы ○ in vitro и in vivo ○ Клеточные / Животные модели ○ Лабораторные животные / Грызуны / Мыши / Крысы ○ Виварий ○ Доклинические / Преклинические исследования ○ Противораковые препараты / Лекарства ○ Цитотоксичность ○ Ангиогенез ○ Биобанк клеток ○ Биомедицина ○ Тераностика и биоимиджинг ○ Адресная терапия ○ Молекулярная / Клеточная биология ○ Биофизика ○ Биомедицина ○ Нанобиотехнологии ○ Наночастицы ○ Наноформуляции ○ Культивирование клеток ○ Исследование фармакокинетики / фармакодинамики ○ Исследования биораспределения ○ Исследования системной токсичности ○ Исследования иммуногенности ○ Генная инженерия ○ Тестирования в направлениях косметологии / пищевой промышленности / загрязнения воздуха 2
6. Перечень компетенций/областей научного интереса лаборатории: ○ Исследования на стыке молекулярной и клеточной биологии, генной инженерии, физики, химии, биотехнологии и нанотехнологий ○ Исследования с использованием бактерий, эукариотических клеток, органоидов, лабораторных грызунов ○ Разработка in vitro клеточных моделей, релевантно отражающих процессы роста и развития опухолей ○ Процессы ангиогенеза солидных медленнорастущих опухолей и их блокировка ○ Линеаризация клеток стромального микроокружения опухоли, их детальная характеристика ○ Создание биобанка опухолевых/раковых клеток, характеристика линий ○ Новые экспериментальные животные модели – иммунокомпетентные мыши с солидными ортотопическими опухолями ○ Разработка методов биоимиджинга процессов распространения опухоли, прижизненный in vivo имиджинг ○ Разработка методов адресной image-guided терапии адресными конструкциями ○ Исследование путей системного введения противораковых агентов в организм ○ Инновационные схемы противораковых терапий ○ Схемы комбинированной (сочетанной) химиотерапии / фототермической / фотодинамической терапии / гипертермии / магнитно-индуцированной терапии ○ Синтез и характеристика наноструктур самой различной природы 7. Перечень основного оборудования: Совместно с лабораторией нанобиотехнологий (рук. Никитин, д.ф.-м.н.): ○ Оборудование для химического, в том числе микроволнового и высокотемпературного синтеза наночастиц, модификации и характеризации нано- и микрочастиц: i. Анализатор наночастиц NTA AstraTrace (Abisense, Россия) ii. Сканирующий электронный микроскоп (Tescan) iii. Магнитная мешалка с подогревом C-Mag HS7 (IKA) iv. Настольные центрифуги 5415D и 5430R (Eppendorf) v. Ротатор Intelli Mixer RM-1L (Elmi) vi. Ультразвуковая баня RK 31H (Bandelin Sonorex) vii. Магнитные сепараторы, водяные и твердотельные термостаты, перемешивающие элементы, газовые баллоны ○ Оборудование для конструирования плазмид, работы с бактериальными штаммами, выделения и очистки белков: i. Хроматографическая система (Biorad) ii. ПЦР-амплификатор (Eppendorf) 3
iii. Спектрофотометры, планшетные анализаторы, ламинарный шкаф для стерильной работы со штаммами прокариотических организмов (LamSys) iv. Система гель-документации (Abisense, Россия) v. Шейкер-инкубатор (New Brunswick Scientific) ○ Оборудование для работы с клетками эукариот: i. Инвертированный флуоресцентный микроскоп (Zeiss) ii. Конфокальный лазерный сканирующий микроскоп (Nikon) iii. Проточный цитофлуориметр (Novocyte) iv. Проточный цитофлуориметр c визуализацией ImageStream (Merck) v. CO2-инкубатор (Binder) vi. Центрифуга с бакет-ротором BR4i Multifunction (Thermo Electron Corporation) vii. Планшетный анализатор (ClarioStar) viii. Ламинарный бокс для работы с эукариотическими клетками класс II (LamSys) ○ Оборудования для проведения экспериментов с животными: i. Магниторезонансный томограф (Brucker Icon 1T) ii. Оригинальный оптический томограф LumoTrace FLUO (Abisense, Россия) iii. Рентгеновский микротомограф MARS (Medipix All Resolution System) iv. Оригинальные MPQ-регистраторы со встроенными катушками v. Оригинальные MPQ-регистраторы с выносными катушками vi. Гематологические анализаторы крови vii. Гематокритная центрифуга viii. Криотом (ThermoFisher) 8. Список публикаций: ○ Источник 1 ○ Источник 2 ○ Источник 3 ● общее количество публикаций за последние 5–10 лет: a. 156 публикаций в GoogleScholar b. 59 публикаций в Scopus c. Суммарный IF по всем публикациям: 382 d. H-index: 23 e. Общее число цитирований: 1483 f. 8 публикации в журналах Q2 ● количество и перечень высокорейтинговых/«топовых» публикаций (Q1 журналы и A* конференции): a. 28 публикаций в журналах Q1 b. 5 докладов на конференциях A* 4